ДНК озерной форели поможет объяснить генетические суперсилы вида

Москва, 14:22, 05 Сен 2019, редакция FTimes.ru, автор Евгения Ковалева.

Ученые из Института Wellcome Sanger вместе с коллегами создали справочный геном озерной форели. Работа поможет понять, принадлежат ли отличающиеся по физическим характеристикам особи к одному виду, и как рыба быстро адаптируется к разным средам.

Секвенированный геном позволит ученым и защитникам природы лучше понять генетические корни видов, определять их подгруппы, разрабатывать стратегии по сохранению, сообщает phys.org. Озерная форель (Salmo trutta) – самое генетически разнообразное позвоночное. Таксономисты когда-то разделяли ее на 50 видов. Некоторые группы всю жизнь живут в пресноводных реках, другие мигрируют между ними и открытым морем. Разные жизненные стратегии помогают объяснить генетические «суперсилы» рыбы. Например, адаптацию, позволяющую менять пресную воду на соленую. Она позволила форели заселить реки после последнего ледникового периода.

Сейчас ученые признают, что не стоит относить всю Salmo trutta к одному виду.

«Новый геном озерной форели стал переломным фактором, — сказал профессор Паоло Продоль из Университета Королевы в Белфасте, который смог сравнить ДНК рыб, принадлежащих, по его мнению, разным видам. – Это позволит отличать рыб, улучшить стратегии по сохранению».

Справочный геном позволит брать и расшифровывать ДНК разных групп, сравнивать их, получая данные о подвидах и их характеристиках. Например, генетические вариации, помогающие шотландской озерной форели адаптироваться к относительно кислым водам, поможет защитить виды, сталкивающиеся с ростом кислотности из-за глобального потепления.

Вид имеет от 38 до 40 хромосом. Они многократно скопированы в геноме. Особи с одним набором были специально выведены норвежским Институтом морских исследований. Ученые из Wellcome Sanger извлекли из них ДНК и использовали технологию PacBio SMRT для создания первого высококачественного справочного генома.

Исследование – часть проекта по секвенированию 25 геномов, включая серую и рыжую белок, беркута, ежевики и малиновки. Он ложится в основу амбициозной программы расшифровки ДНК всех 60 000 комплексных видов Великобритании.