Предложен новый метод визуализации биологических молекул
Москва, 09:49, 06 Сен 2019, редакция FTimes.ru, автор Евгения Ковалева.
Европейские специалисты разработали новый способ создания изображений молекул в клетках или образцах тканей. Он основан на использовании кусочков ДНК.
Исследование было проведено учеными из шведского Каролинского института и финского Университета Аалто, сообщает eurekalert.org. Его результаты опубликованы в журнале PNAS.
Новый метод называется ДНК-микроскопией. Сначала исследователи смешивают клетки, образцы тканей, с короткими последовательностями однонитевых ДНК, выбранных для крепления к специфическим молекулам. Так, если материал содержит определенные белки, будут использоваться соединяющиеся с ними отрезки. На следующем этапе последовательностям скармливают ферменты для формирования ДНК-молекул.
Анализ получившихся структур позволяет точно определить, какие отрезки оказались рядом. Основываясь на этой информации, можно понять, как связаны все последовательности ДНК. Метод позволяет определить концентрацию и положение целевых молекул. Исследователи представили математическую модель для подсчета и визуализации информации.
«Процесс можно сравнить с рассадкой гостей на свадьбе, где каждое место сопровождается табличкой с именем. Имея их все, можно воссоздать положение людей. В наших экспериментах табличками были отрезки ДНК, гостями – молекулы, к которым они крепились», — сказал профессор Каролинского института Бьёрн Хегберг.
Преимуществ метода – возможность поиска специфических молекул в крупном образце. Стандартная микроскопия тратит на это много времени. Метод также позволяет определить, какую роль текущее окружение играет в жизни клеток. То есть, как микросреда может влиять на развитие болезни.
«Инструмент позволит лучше понять биологические функции и взаимодействие клеток. В долгосрочной перспективе он поможет в повышении безопасности диагностики», — сказал координатор исследования, Йен Хоффкер из исследовательской группы Хегберга.
