Ученые разработали тест, который может обнаружить любой вирус

Москва, 16:42, 13 Ноя 2015, редакция FTimes.ru, автор Сергей Кузнецов.

Ученые разработали тест, который может обнаружить не только любой известный вирус, но и его подтип, а также предсказать вирусные эпидемии.

Исследовательская команда под руководством школы медицины Вашингтонского университета в Сент-Луисе (WUSTL) собрала около 1 миллиарда пар оснований вирусных ДНК-последовательностей, чтобы создать тест, который они назвали ViroCap.

«С помощью этого теста, Вы не должны знать то, что вы ищете. Он бросает широкую сеть и может эффективно обнаружить вирусы, которые присутствуют на очень низких уровнях. Мы думаем, что тест будет особенно полезен в ситуациях, когда диагноз остается неуловимым после стандартных исследований или в ситуациях, когда причина вспышки заболевания неизвестна», —  сказал автор исследования, профессор Грегори Шторх.

Для разработки теста исследователи брали уникальные участки ДНК или РНК из каждой известной группы вирусов, которая заражает позвоночных – в том числе 2 миллиона уникальных участков генетического материала. Эти участки материала были использованы в качестве зондов, которые могут выделить вирусы из образца и найти генетическое сходство. Совпавший вирусный материал затем анализируют методом генетического секвенирования с высокой пропускной способностью.

Ученые проверили эффективность теста, сравнивая его со стандартными тестами, которые полагаются на секвенирование генома. Результаты показали, что стандартному тестированию не удалось обнаружить распространенные вирусы, такие, как грипп B, пареховирус, вирус герпеса и ветряной оспы. Новой технологии, однако, удалось обнаружить вирусы, не замеченные стандартным тестом, и дополнительно выявить аденовирусы Тип B и Тип 3А, которые могут вызывать тяжелые инфекции у некоторых больных.

Кроме того, тест включает в себя подробную генетическую информацию о различных штаммах вирусов, что позволяет оперативно идентифицировать подтипы вируса. Во время стандартного тестирования был выявлен вирус гриппа А, который вызывает сезонный грипп, и новый тест подтвердил, что вирус был особенно опасным подтипом Н3N2.

Научный сотрудник Тодд Уайли сказал: «Тест настолько чувствителен, что обнаруживает также вариантные штаммы вирусов, которые тесно связаны генетически. Незначительные генетические вариации среди вирусов часто не могут быть различены в настоящее время доступными тестами и усложняют врачам возможность обнаружения всех вариантов с одного теста».

Исследователи надеются, что новый тест может быть использован для обнаружения вспышек смертельных вирусов, таких как Эбола, Марбург и тяжелого острого респираторного синдрома, а также более обычных вирусов, включая ротавирус и норовирус, которые вызывают тяжелые желудочно-кишечные инфекции. Они считают, что тест может быть модифицирован для обнаружения патогенов, отличных от вирусов, включающих бактерии, грибки и другие микроорганизмы, а также генов, которые указывают на устойчивость возбудителя к лечению.