Ученые обнаружили в Бразилии таинственный вирус с неизвестными науке генами

Москва, 11:48, 10 Фев 2020, редакция FTimes.ru, автор Сергей Кузнецов.

Ученые определили загадочный вирус, геном которого, кажется, почти полностью новый для науки, населенный незнакомыми генами, которые никогда ранее не были документированы в вирусных исследованиях.

Так называемый Яравирус (Yaravirus brasiliensis), названный в честь Яры — или Иары, водной королевы в бразильской мифологии — был обнаружен на искусственном озере Пампулха в бразильском городе Белу-Оризонти.

Вирус представляет собой «новую линию амебного вируса с удивительным происхождением и филогенией», — объясняет исследовательская группа в новой предварительной публикации об открытии.

Двое из членов этой команды — вирусологи Бернар Ла Скола из Университета Экс-Марсель во Франции и Йонатас С. Абрахан из Федерального университета Бразилии в Минас-Жерайс — знают, о чем они говорят.

Два года назад эта пара ученых помогла обнаружить еще одну водную вирусную новинку: Тупанвирус, гигантский вирус, обнаруженный в экстремальных водных средах обитания. Гигантские вирусы, в отличие от обычных, так называются из-за их огромных капсидов (белковых оболочек, которые инкапсулируют вирионы — вирусные частицы).

Эти гораздо более крупные вирусные формы были обнаружены только в этом веке, но они отличаются не только своими размерами. Они также обладают более сложными геномами, что дает им возможность синтезировать белки и, следовательно, выполнять такие вещи, как репарация ДНК, а также репликация, транскрипция и трансляция ДНК.

До их открытия считалось, что вирусы не могут делать ничего подобного, считаясь относительно инертными, неживыми существами, способными только заражать своих хозяев.

Теперь мы знаем, что вирусы намного сложнее, чем когда-то считалось, и в последние годы ученые обнаружили другие виды вирусных форм, которые также бросают вызов нашему представлению о том, как вирусы могут распространяться и функционировать.

Вновь открытый Яравирус, похоже, не является гигантским вирусом, состоящим из мелких частиц размером 80 нм. Но что в нем примечательно, так это то, насколько уникален его геном.

«Было замечено, что большинство известных вирусов амебы имеют много общих черт, которые в конечном итоге побудили авторов классифицировать их в общие эволюционные группы», — пишут авторы.

«В отличие от того, что наблюдается у других изолированных вирусов амебы, Яравирус не представлен гигантской частицей и сложным геномом, но в то же время несет значительное количество ранее неописанных генов».

В своих исследованиях ученые обнаружили, что более 90 процентов генов Яравируса никогда не были описаны ранее, составляя так называемые орфанные гены (также известные как ORFans).

Только шесть найденных генов имеют отдаленное сходство с известными вирусными генами, задокументированными в публичных научных базах данных, и поиск по более чем 8500 общедоступным метагеномам не дал никаких подсказок относительно того, с чем может быть тесно связан Яравирус.

«Используя стандартные протоколы, наш самый первый генетический анализ не смог обнаружить какие-либо узнаваемые последовательности капсида или других классических вирусных генов в Яравирусе», — объясняют исследователи.

«Следуя текущим метагеномным протоколам обнаружения вирусов, Яравирус даже не будет признан вирусным агентом».

Что же касается того, чем на самом деле является Яравирус, то ученые могут пока только строить догадки, но предполагают, что это может быть первый изолированный случай неизвестной группы амебного вируса или потенциально отдаленного вида гигантского вируса, который мог каким-то образом эволюционировать в уменьшенную форму.

«В любом случае, ясно, что нам еще предстоит многому научиться», — говорят исследователи.